设疑，是我国当前基础教育课程改革的理念所要求的，也是当前教育中一种非常重要的教学策略。从当前义务教育改革的教育目标来看，包括知识、能力、情感、态度和价值观四大方面，教师在教学中设疑应该紧紧围绕这些来进行：
知识：选择核心内容进行设疑 因为学生在校学习的重要目的之一是获得未来学习所必需的基础知识，这些知识是学生未来知识大厦的基础，只有学生获得了这些基础才有可能为未来奠基。因此，设疑的出发点就需要有很强的指向性和目的性，从核心知识的获得出发设计疑问。
例如，在生物学教学中，当学生发现组成生物体的基本结构和功能单位是细胞时，教师所设的第一个疑问就可以是:“为什么细胞是构成生物体的基本结构和功能单位？它有什么意义？”随之，相关的一系列疑问就会应运而生。
价值：选取值得的问题进行设疑 因为只有有研究价值的问题，才能引起学生思维的深刻变化，才能调动起学生的兴趣和积极性。苏联著名的教育家苏姆林斯基说：“如果教师不想办法使学生产生情绪高昂和智力振奋的内心状态，就急于传授知识，那么这种知识只能使人产生冷漠的态度，而使不动感情的脑力劳动带来疲劳。”
如语文课、政治课等，都可根据教学内容，选择一些有研究价值的某些社会现象进行观察和分析。
能力：选择有助学生思维能力的训练 让学生通过思考和探索，使思维活动走向深刻，从而既获得知识，又形成用科学的眼光去看待、思考和解决问题的意识和习惯。这也就是说，要使学生的思维在认知、理解、运用、分析、综合和评价等各种能力等各方面都得以提高，而不要停留在浅表层面。
例如一些物理现象和化学现象的解释，教师就可以设置出多种疑问，让学生通过多种实验方法实验或验证，直至发现正确的解释和阐述。
态度：选择有助培养学生科学态度的方法 因为当代社会更需要不仅知识丰富，而且人格健全的公民。例如，在历史课的教学中，对于一些政治任务推出一系列政治措施的原因，就可以让学生结合当时当地的状况进行推理和解释，从而在情感、态度和价值观方面有所收获。
此外，设疑还需要适量、适时和适度。就是说教师应将设疑控制合适的总量，选择合适的教学内容适用设疑方式，同时教师所设的疑问还要是在学生当前水平下有可能解决的等。因为不适当的使用只会适得其反。
思考：设疑的误区
然而，综观现在教师在教学中的多种设疑方式，却发现有些教师对为什么要设疑，以及如何设疑等还存在着一些模糊的认识，从而导致教学中出现了一些误区。
一、将设疑从某种程度上理解成学生对教师试卷设计的挑错。有的教师在考试试卷的设计中无意出了错，当被学生发现后，老师“灵机一动”，认为这是培养学生质疑精神的一种方式，自此后，在试卷中开始故意设计出错题，对能够发现问题的学生表扬，并提高这些学生的评价成绩。
二、将设疑理解为学生对于教师在教学中出现错误的发现。如有的老师故意将本该是正确的内容写成错误的，在黑板上写错字，做错题，写错音乐符号等等。当这些情况被学生发现后，教师也同样是开始将这种现象“升华”为一种教学设疑策略，认为可以培养学生的质疑的精神，于是类似的错误开始频频出现，学生成了教师教学中的挑错专家。
三、对于一些专业术语的定名设疑。例如，有的教师在向学生传授数个学术概念时，首先一定要让学生给定名，于是学生开始出现了五花八门的定名，有的定名甚至变成了胡说，之后教师在混乱一阵之后说出科学名。
以上种种，在现阶段的教学中都已经不再是个别现象，有的教师甚至认为自己的想法还别具一格。然而，事实是，这样的误导在很大程度上干扰了正常教学。